Продекани Медицинског факултета Војномедицинске академије Универзитета одбране у Београду помажу декану у обављању послова из његове надлежности. Факултет има три продекана.
Продекане именује министар одбране, на предлог декана из реда наставника Факултета. За свој рад одговарају декану и Савету. Продекани организују и воде послове у одређеним областима из делатности Факултета за које их овласти декан, у складу са општим актима Универзитета и Факултета.

Продекан за наставу Медицинског факултета Војномедицинске академије Универзитета одбране у Београду
ВС проф. др Снежана Ђорђевић

Продекан за докторске и специјалистичке студије Медицинског факултета Војномедицинске академије Универзитета одбране у Београду
потпуковник проф. др Бобан Ђорђевић

Продекан за научноистраживачки рад Медицинског факултета Војномедицинске академије Универзитета одбране у Београду
ВС проф. др Силва Добрић